1、注冊資本限制不同：一般納稅人在登記注冊時，最低注冊資金不得低于3萬元，如注冊的是有限公司，最低注冊資金不得低于10萬元；而個體工商戶沒有最低注冊資金的限制；
2、公司章程限制不同：一般納稅人在登記注冊時必須提供公司章程；而個體工商戶登記注冊時無需公司章程；
3、申請稅率不同：一般納稅人可申請17%的一般納稅人增值稅發(fā)票；個體工商戶只能申請小規(guī)模納稅人，不能申請一般納稅人增值稅發(fā)票；
4、計稅方式不同：一般納稅人要求有健全的財務體系，需要定時報賬，納稅金額也與企業(yè)申報的營收相關(guān)。簡單點說，就是有收入就按比例納稅，沒收入就無需繳納；而個體工商戶是國家稅務機關(guān)根據(jù)其具體信息，例如：規(guī)模、員工人數(shù)、產(chǎn)品種類等，估算銷售額后，指定稅率。個體工商戶需按時繳納，不論當月是否有收入，納稅金額不變；
5、納稅方式不同：一般納稅人不僅需要繳納個人所得稅還需要繳納企業(yè)所得稅，營業(yè)部分按發(fā)票征稅，經(jīng)營所得部分按核定征收或查賬征稅；而個體工商戶只需繳納個人所得稅，其征收方式是定額定律的。
個體戶相較一般納稅人的缺點
1、個體工商戶不能轉(zhuǎn)讓、變更；
2、個體戶不能開設分支機構(gòu)；
3、個體戶不能有其它投資人或合伙人；
4、個體戶獨立經(jīng)營，同時需要獨立承擔所有責任，因此風險較大；
5、個體戶相較于一般納稅人可享受的政府優(yōu)惠政策較少。
